上海交通大学医学院附属仁济医院西院地处上海市黄浦区中央商务区，毗邻外滩，目前占地面积为7811㎡，总建筑面积为31959㎡，开放床位共460张，年门诊量达79万人次，出院1.7万人次，手术1.1万例。
医院设有39个临床科室。在坚持强化老牌优势专科的同时，仁济西院不断探索多科协作与资源整合，努力发展新兴学科和亚专业。特色专科主要包括：消化内科、风湿病科、泌尿外科、功能神经科、妇科肿瘤科、头颈外科、产科、重症监护室（ICU）。
其中，消化内科是国家临床重点专科和上海市消化内科临床医学中心，精于消化道肿瘤和癌前疾病、幽门螺杆菌及其相关疾病、慢性肝病（肝纤维化和非病毒性肝病）的诊断和防治研究，年门急诊量居国内第一，总体处于国内领先地位，某些领域达国际先进水平。
风湿病科是国内最早研究风湿病专业的单位之一，目前为上海市风湿病学临床医学中心，在国内率先建立多种早期诊断红斑狼疮等风湿病的抗体谱，经过数十年的研究探索，建有风湿病红斑狼疮病例的国际标准大型数据库，能够开展风湿病前沿诊疗技术，如关节B超、双光子骨密度仪、临床药物试验，创立风湿病医疗健身中心，建成上海市自身抗体参比实验室，进行免疫吸附治疗重症风湿病、SLE合并妊娠等最新课题研究。
泌尿外科是国内年门急诊量、手术量首屈一指的大型泌尿外科临床诊疗中心，以腹腔镜和微创为重点技术，建有完善的亚专业小组，针对性地开设了前列腺肿瘤、膀胱肿瘤、造口门诊和尿频尿急专病门诊。
功能神经科拥有华东地区最大规模的视频脑电监测系统、国际上最先进的神经导航工作站、立体定向仪等设备，整合国内一流神经内科、神经外科、儿科和电生理专家于一体，专攻难治性癫痫、帕金森病、顽固性疼痛、强迫症、三叉神经痛和面肌痉挛等功能性疾病。
妇科肿瘤科收治各类妇科良恶性肿瘤患者，针对良性肿瘤如卵巢/输卵管良性囊肿、子宫内膜异位症、子宫肌瘤、子宫肌腺症等，腹腔镜手术率达98%以上；针对恶性肿瘤，能够开展风险较大难度较高的子宫内膜癌分期手术、子宫颈癌根治术、早期卵巢癌全面分期术、外阴癌腹股沟淋巴结清扫术等，腹腔镜手术率达85%以上。随着妇科肿瘤年轻化，开展“保留生育功能和保留神经功能的宫颈癌根治术”等一系列国内外最新腹腔镜手术。
头颈外科整合原耳鼻咽喉头颈外科、普外科优势医疗资源，专门治疗头颈部各类良恶性疾病，主要包括甲状腺和甲状旁腺肿瘤、腮腺和颌下腺肿瘤、咽喉部、下咽部和口咽部肿瘤，在头颈边缘肿瘤的外科治疗、甲状腺微创手术上有所突破，具有手术量多、术式全、预后佳、涉及学科广的特点。
产科是医院首批国家临床重点专科之一、上海市危重孕产妇会诊抢救中心、上海市产前诊断中心和上海市产科心脏病监护中心。擅长妊娠合并症和妊娠并发症的诊治，尤其在妊娠合并心脏病、妊娠期高血压疾病（子痫前期）、妊娠合并系统性红斑狼疮等妊娠期疑难危重症方面，居国内领先地位。改建后的仁济西院产科病区配备了先进的医疗设备，如胎儿中央监护系统，LDR产房（家庭化产房）、家属陪伴分娩、导乐分娩、无痛分娩、孕妇学校。
重症监护室ICU：层流病房设置床位16张，其中单人负压病房8间，每张床位配有先进的监护仪、呼吸机、自动化多功能病床、进口输液泵，以及血气分析仪、变温毯等其他急救复苏设备。自20世纪70年代建立心胸外科ICU，重症监护治疗技术在医院得到长足发展，包括机械通气、动脉/中心静脉穿刺置管、经皮穿刺气管切开、呼吸循环功能监测、纤维支气管镜应用、肾脏替代治疗、超声引导下穿刺等技术。
2011年2月，仁济西院正式启动综合改建工程。2013年7月，住院楼改建完成并顺利启用。目前处于门诊楼改建阶段，预计2014年底完工。
