南京明基医院为明基友达集团本着回馈社会、服务民众的精神，投资设立的中外合资合作医院。南京明基医院依据国家三级医院标准建立，占地600亩。整个工程分三期，其中一期投资约11亿元人民币，主要以开展普通医疗与特需医疗服务为目标，建成1,500床；二、三期将增加科研实验、临床教学及健康促进等医疗项目，最终将发展至3,000床规模。
南京明基医院设有内、外、妇、儿、中医等一级临床科室，配备检验、影像、病理、实验室等医技科室，高水平配置内镜中心、重症监护病房（ICU）、国际医疗中心、血液净化中心等，提供普通医疗、特需医疗、健康管理等综合服务，开展医疗、康复、预防保健、科研、教学等医学活动。为南京医科大学附属医院，南京中医药大学教学医院，拥有众多台湾、海外及大陆医疗专家200余名为民众提供高品质的医疗服务。
南京明基医院汇聚来自台湾、大陆及海外医疗专家近200名，为民众提供多学科、高水准医疗服务。目前，除设有门急诊、医学检查以及住院等基本功能之外，南京明基医院还可以针对病患的不同需求，特别提供VIP及延伸医疗的服务。胸外科、心脏科、普外科、骨科、泌尿外科、神经外科、肾内科、消化内科、眼科等均为医院初期的特色科室。并且已开设血液净化中心、重症监护病房（ICU）、内镜中心、国际医疗中心等。
南京明基医院拥有一流的医疗设施，设有百级与千级手术室共32间，高品质配备血液净化中心，设有进口监护设备的重症监护病房。明基医院还全面导入支持高效运作的PACS（医学影像归档和通信系统）、LIS（实验室信息系统）以及HIS（健康照护信息系统）等软件资讯管理系统。
