医院始建于1952年，由一个总部、三个社区卫生服务中心和二十一个社区卫生服务站组成，是一家集基本医疗、社区卫生服务和公共卫生服务为一体的二级医院，是唯一具有三级垂直医疗服务模式的区属医疗单位，网络内实行“五统一”工作机制。为杭州市中医院临平分院，浙江大学医学院附属口腔医院协作医院。医院位于老城区，占地面积26亩，医疗用房3.3万平方米，首期开放床位250张。医院现有职工808人，其中在编职工621人，高级职称49人，中级职称127人。2014年总服务人次172万。
医院为全国院务公开示范点、浙江省文明单位、浙江省平安医院、浙江省绿色医院、浙江省健康促进医院、浙江省全科医学社区培训基地、浙江省五星级规范化预防接种中心、杭州市健康单位，杭州市绿色医院，杭州市青年志愿者服务标兵单位，杭州市文明单位，余杭区人才培训基地、余杭区临平口腔专科医院。拥有螺旋CT、DR、口腔CT、胃肠机、C臂机、彩超、全自动生化分析仪、血凝仪、化学发光仪、胃镜、肠镜等高端医疗设备150余件。
医院坚持大专科、小综合发展定位，消化内科（脾胃病）、口腔科、内分泌科、骨伤科、普外科、神经内科、肿瘤内科、皮肤科、全科医疗科、针灸疳积科为院级重点学科，其中中医脾胃病通过杭州市重点专科（专病）建设项目验收，内分泌科为余杭区名科，口腔科和消化内科为区级重点学科。
