杭锦后旗医院始建于1952年，经过六十多年的探索改革，创新发展，现已成为一所集医疗、救治、预防保健、康复指导、人才培训、技术指导、科研教学于一体的国家二级甲等综合性医院，承担着全旗三十多万人口及周边地区广大农牧民的医疗健康重任，是巴彦淖尔市“120急救中心”指定的杭锦后旗“急救中心”，是医保农合、交通肇事、工（公）伤鉴定指定医院。
医院占地31369平方米，建筑面积38300平方米，开放病床500多张，在岗职工526人，其中中高级技术人才291人，研究生2人，设有心内科、神经内科、呼吸内科、普外科、神经外科、泌尿外科、肿瘤外科、妇产科、儿科、急诊科、麻醉科、综合科、骨科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、中医科、皮肤科、肛肠科、体检科、康复科、不孕不育科、糖尿病专科、高压氧科、ICU科等临床科室20多个，以及检验科、放射科、B超、CT室、病理科、脑彩超室、胃镜室、心脑电图室等医技检查科室10余个，行政职能科20余个。
医院拥有最先进的层流净化室、进口麻醉机、外科超声刀、德国腹腔镜、宫腔镜、德国电切镜、全身螺旋CT、美国产CR、DR、1000毫安X光机、C型臂X光机、美国GE彩色多普勒、全自动生化分析仪、全自动血球计数仪、奥林巴斯电子胃、肠镜、血液透析机、碎石机、高压氧舱、康复理疗等医疗设备和各类呼吸机、监护仪等先进设备是一所科室设置齐全，服务功能完善，技术力量雄厚的综合性医院。多年来医院凭借良好的服务信誉和精湛的医疗技术赢得了广大人民群众的信赖和好评。1997年率先成为内蒙西部首家旗县级“二级甲等”医院。曾先后获得“内蒙古自治区文明医院”、“内蒙古自治区卫生系统先进集体”等，2005年在全国医疗市场经营活动中被评为“医疗优质、服务满意、价格合理、放心医院”诚信单位。
