南京梅山医院是一所医疗设施齐全的综合性医院。1969年6月，梅山钢铁大会战开始时，由上海第一医学院等组成的一支三十人的医疗小分队在一片荒原上白手起家，为建设者服务。1970年6月，九四二四工程指挥部职工医院正式成立。1993年，经上海市卫生局评审为二级甲等医院。2000年6月，正式更名为南京梅山医院。2003年7月30日加入鼓楼医院集团；2004年4月，梅山第二医院（梅山铁矿医院）成为梅山医院分院。自2003年起，医院医政工作属地于南京市卫生局管理。
梅山医院占地面积42002.1平方米，建筑面积37293.6平方米。目前设有一个医院（公司和铁矿两处执业地点）和两个社区卫生服务站。
医院有职能部门8个，总院有临床医技科室26个，分院临床医技科室11个。核定床位505张，设内科、外科、妇产科、儿科、麻醉、感染、康复（高压氧）、眼耳鼻喉、口腔、重症监护、肿瘤、特需、精神、急诊、肾内、皮肤等临床科室，设有放射、功能、检验、药剂、病理等医技科室，设有洁净手术中心、血透中心、高压氧舱中心、碎石中心、DSA中心、体检中心、肿瘤科热疗中心等。麻醉科、ICU、骨科、神经内科为南京市二级医院医学重点专科，同时医院在创伤急救、骨科、精神科、肿瘤等专科特色治疗在南京市具有一定影响。
医院现有员工总数775人，（其中，正式员工523人，合同制员工224人，返聘8人）。卫生技术人员608人，占78.45%；行政管理人员66人，占8.52%；工勤人员101人，占13.03%。有高级职称35人，中级职称285人，初级职称294人。
医院先后投入资金配备先进的医疗设备和仪器，现拥有万元以上医疗设备304台（套），百万元以上医疗设备12台。如：MR(核磁共振仪)、CT、高压氧舱、数字减影血管造影仪（DSA）、血液透析仪、复式脉冲碎石机、全自动血气分析仪、全自动生化分析仪、化学发光仪、全自动麻醉机、内镜治疗仪、彩超、心脏负荷运动平板测试仪、全自动呼吸机、腹腔镜、纤维胃镜、肠镜、手术显微镜等。为临床及时诊断、疾病治疗提供了硬件保证；为梅山医院的发展赢得了先机，也进一步推进大专科、小综合的发展战略的实现。
2011年医院门急诊病人近40万人次，出院病人1万余人次。医院特色项目：消化专科开展内镜下胃肠息肉取出术；血液净化中心开展救治重症药物、毒物中毒病员及急慢性肾功能衰竭病人；肿瘤科热疗中心的治疗使用和肿瘤分子靶向治疗，与放射科联合开展了肿瘤介入治疗和内腔支架安置术；骨科开展断肢断指再植与脊柱外科手术、四肢肿瘤根治和关节假体置换术；胸外科可开展肺叶全切、心脏破裂缝合术及胸腔镜辅助下肺大疱切除、血气胸探查修补术等；普外科开展了肝癌、门静脉高压症及胆胰肿瘤手术，运用腹腔镜治疗胆石症等微创术；泌尿外科开展前列腺、睾丸肿瘤切除术、体外碎石术；眼科使用超乳加人工晶体植入治疗老年白内障；脑外科在颅脑创伤清创及修补术方面等也积累丰富经验，妇产科开展全子宫切除加盆腔淋巴活检术、宫颈TCT检查、腹腔镜下子宫内膜异位囊中剥除术等。
梅医人坚持“以病人为中心”的服务宗旨，发扬“还健康于病人，献爱心于社会”的梅医精神，坚持科学发展观，坚持“一切为了病人，为了一切病人”的服务理念，用实际行动实践“团结、敬业、仁爱、守信”院训格言，为广大患者提供优质医疗及健康保健服务，实现医院的和谐、科学发展。医院连续十届被评为上海市卫生系统文明单位、多次荣获南京市“三信三优”单位等。
